按照穆宗的布置，高拱是外廷的顾命大臣中排名最前的；在宫中，小皇帝自然还得依靠冯保。

但是，冯保与高拱的关系非常恶劣。

此前，司礼监几次掌印太监职位空缺，高拱先后推荐了陈洪、孟冲，就是不愿让冯保做掌印太监。

冯保此人知书达礼，又喜爱琴棋书画，很有涵养，所以很受穆宗的喜爱。

冯保利用皇权更迭之间的权力真空，轻松地通过一道遗诏，就驱走了孟冲，自己做了掌印太监。

但是，就高拱来说，对冯保自然是必欲除之而后快。

在高拱的授意下，工科都给事中程文、吏科都给事中雒遵、礼科都给事中陆树德都开始弹劾冯保。

由此，一场政治斗争势必不免。

斗争中，冲突双方是冯保和高拱，而张居正表面上是帮助高拱的。

但是，实际上，张居正与冯保关系非常密切，早就预谋赶走高拱了。

据高拱后来回忆说，张居正每次看护小皇帝读书，总是和冯保到文华殿东小房里密谈，直到小皇帝讲学完毕才结束。

高拱与张居正本同属穆宗裕邸旧臣，关系甚睦，&ot;两人欢相得，不啻（chì）兄弟&ot;。

但是，张居正显然是一个典型的两面派，一方面赞同高拱驱逐冯保的建议，一方面与冯保密谋如何驱逐高拱。

高拱则自视甚高，把事情的复杂性估计过低，加上性格粗直，容易被人揪住辫子。

冯保想起穆宗刚死的时候，高拱在内阁对同僚们说的一句话--&ot;十岁太子如何治天下？&ot;冯保深知，这句话足以扳倒高拱。

于是，冯保到皇太后和皇太贵妃那边说：&ot;高拱斥太子十岁孩子如何作人主。

&ot;皇太后和皇太贵妃听后都大惊，万历小皇帝听了面色立即大变。

六月十六日早朝，宫中传出话来：&ot;有旨，召内阁、五府、六部众至。

&ot;高拱兴高采烈，以为将颁布驱逐冯保的诏旨。

张居正则面色如水，心中有数。

到会极门时，太监王榛（zhēn）已捧圣旨出，说：&ot;张老先生接旨！

&ot;接下来宣读：&ot;今有大学士高拱专权擅政，把朝廷威福都强夺自专，通不许皇帝主专。

不知他要何为？我母子三人惊惧不宁。

高拱著回籍闲住，不许停留。

&ot;这一段话，可惊得高拱面如死灰，汗下如雨，浑身瘫软，伏地不能起。

第二天，高拱坐着一辆骡车离开京城，由于仆婢都逃逸了，身上没多少钱，只能到一些小店里吃饭。

一直到了良乡，才得到张居正为他请来的驿传勘合，可以坐着政府的驿传还乡。

高拱一走，高仪也坐不住了，惊得呕血三日而亡。

至此，三位内阁顾命大臣中只剩下张居正一人，担当辅弼小皇帝的重任。

从此以后，万历朝的前10年，小皇帝的生活基本上是受三个人的规范：一个是自己的母亲慈圣李太后，一个是司礼监掌印太李太后像监冯保，一个是内阁大学士张居正。

神宗需要侍奉两位母亲。

一位是嫡母仁圣皇太后，即原来穆宗的皇后陈氏；一位是生母慈圣皇太后李氏。

仁圣皇太后体弱多病，不能生育，却很疼爱小皇帝。

据说，小皇帝还是太子的时候，经常去皇后那里玩。

陈氏每次听见太子跑的鞋声，就非常高兴。

所以，神宗虽然尊崇自己的生母李氏，即改变过去皇帝生母只称&ot;徽号加太后&ot;的惯例，为李氏加&ot;皇&ot;字，称&ot;慈圣皇太后&ot;，但是，对于嫡母仁圣皇太后始终非常尊敬，一视同仁，备极孝心。